Een gouden standaard voor het analyseren en classificeren van het vaginoom
Het vaginoom, ook wel het microbioom van de vagina, speelt een belangrijke rol bij de gezondheid van vrouwen. De impact van een ongezond vaginoom is enorm. Uit onderzoek is gebleken dat een positieve humaan papillomavirus (HPV) test en een aanhoudende HPV infectie mogelijk is geassocieerd met een disbalans in het vaginoom. Het is daarom belangrijkom het vaginoom beter te kunnen analyseren in de relatie tot HPV. In het onderzoek ‘Unraveling the Vaginome’ ontwikkelen onderzoekers een gouden standaard voor het analyseren van het vaginoom door gebruik te maken van next-generation sequencing.
Wat is de aanleiding van het project?
Het vaginoom speelt een essentiële rol bij de gezondheid van vrouwen. Het vaginoom bevat met name Lactobacillus bacteriën. De impact van een ongezond vaginoom is enorm, waaronder een vergroot risico op complicaties bij zwangerschap en bevalling, maar ook bij seksueel overdraagbare infecties, zoals door HPV.
Humaan papillomavirus (HPV)
Zo’n 80 tot 90% van alle mensen wordt minstens één keer in hun leven besmet met HPV. Het virus kent meer dan 200 verschillende typen. Sommige typen behoren tot de hoog-risico HPV-groep en kunnen na lange tijd kanker veroorzaken.
Wanneer iemand met HPV besmet wordt, is dat vaak zonder symptomen. Het lichaam ruimt meestal de infectie binnen 1 tot 2 jaar op. Echter, wanneer het afweersysteem de infectie niet opruimt, kan er na 10 tot 15 jaar (baarmoederhals)kanker ontstaan. Baarmoederhalskanker staat op nummer vier van de meest voorkomende kankers bij vrouwen.
Zo maken we impact
"Een gouden standaard voor het analyseren van het vaginoom draagt bij aan betere inzichten van de rol van het vaginoom bij de ontwikkeling van baarmoederhalskanker"
Wat is het doel van het project?
Uit onderzoek blijkt dat vrouwen die positief testen op HPV mogelijk een disbalans hebben in het vaginoom. Daarom is het belangrijk dat we het vaginoom kunnen analyseren voor toekomstig diagnostisch gebruik. Op dit moment is er geen gouden standaard om het vaginoom in kaart te brengen en de diversiteit te classificeren.
Het doel van het project ‘Unravelling the Vaginome’ is het ontwikkelen van een gouden standaard voor het analyseren en classificeren van het vaginoom. Deze gouden standaard draagt bij aan betere inzichten van de rol van het vaginoom bij de ontwikkeling van baarmoederhalskanker.
Hoe gaan we te werk?
Een veelgebruikte techniek om een microbioom in kaart te brengen is next-generation sequencing. Dat is een technologie die de volgorde van bouwstenen van DNA of RNA snel en efficiënt kan lezen.
Door samen te werken met met Fontys (lectoraat Molecular Technologies for One Health), het Jeroen Bosch expertisecentrum voor diagnostiek van HPV, Universiteit Maastricht, Academisch ziekenhuis Maastricht en mkb partijen gaan we gestandaardiseerde protocollen ontwikkelen voor sequencing van het vaginoom bij vrouwen die getest zijn op HPV. De kracht van het consortium zorgt ervoor dat die protocollen worden ontwikkeld en gevalideerd.
Eefje Schrauwen, associate lector ‘Infectieziekten’ bij Centre of Expertise Perspectief in Gezondheid, is ervaren in nanopore sequencing ten aanzien van het microbioom en infectieziekten en de daarbij behorende analyses. Samen met studenten van Avans Hogeschool ontwikkelt Eefje bioinformatica pipelines om toekomstige datasets eenvoudig(er) te kunnen analyseren.
Met wie werken wij samen?
In het project werken wij samen met het Fontys lectoraat Molecular Technologies for One Health, Jeroen Bosch Expertisecentrum voor Diagnostiek van HPV, Universiteit Maastricht, Academisch Ziekenhuis Maastricht, Pathologie DNA BV, Molecular Biology Systems en Isogen Life Science.
Het project wordt gesubsidieerd door een SIA RAAK-publiek.
